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Relax è progettato per lo studio della dinamica delle proteine o di altre macromolecole anche se l'analisi dei dati di rilassamento NMR.
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  • Rating:
  • Licenza:
  • GPL
  • Prezzo:
  • FREE
  • Nome editore:
  • Edward d'Auvergne
  • Sito web dell'editore:
  • https://gna.org/projects/minfx/

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relax Descrizione

Relax è progettato per lo studio della dinamica delle proteine o di altre macromolecole anche se l'analisi dei dati di rilassamento NMR. NMR-Relax è progettato per lo studio della dinamica delle proteine o di altre macromolecole anche se l'analisi dei dati di rilassamento NMR. Il suo scopo principale è per l'analisi del modello di Lipari e Szabo dei tassi di rilassamento R1 e R2 insieme allo stato costante eteronucleare noe. Il programma supporta anche il raccordo della curva di rilassamento per il calcolo dei tassi R1 e R2 e dei loro errori, il calcolo del Noe e il suo errore e la riduzione della mappatura della densità spettrale. L'obiettivo del relax è quello di fornire un ambiente senza soluzione di continuità ed estremamente flessibile in grado di Accettare l'input in qualsiasi formato prodotto da altri software NMR, in grado di creare erroneamente file di input, controllare e leggere l'output da vari programmi, tra cui ModelFree e Dasha, risultati di output in molti formati e visualizzano i dati controllando programmi come grazia, opendx, E MOLMOL.Tutte gli strumenti di analisi dei dati dall'ottimizzazione alla selezione del modello a Monte Carlo Simulations sono incorporati in relax. Pertanto, l'uso di programmi aggiuntivi è opzionale. La potenza di Pythonthe flessibilità del relax nasce dalla scelta delle funzionalità di scripting del relax o della sua interfaccia del prompt Python. Gli script estremamente complessi possono essere creati da semplici edifici per automatizzare completamente l'analisi dei dati. Sono stati forniti un numero di script campioni per aiutare a comprendere la costruzione dello script. Inoltre, qualsiasi potente o funzioni o funzioni di Python possono essere incorporate in quanto lo script viene eseguito come un file sorgente di Python arbitrario all'interno dell'ambiente di relax.requirementi: · Python 2.4Questo è nuovo in questa versione: · Supporto preliminare per i dati e la grazia di RNA / DNA Sono state aggiunte compatibilità per la riduzione della mappatura della densità spettrale ridotta. · Questa versione corregge i guasti della selezione del modello tra i modelli di diffusione globali quando si utilizzano i modelli TM locali, l'eliminazione del modello quando viene utilizzato il modello "M0" e la lettura dei file dei risultati privi di modelli da Versione 1.2.4 e prima.


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