Sistema E-Cell

Un ambiente di modellazione e software di simulazione.
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Sistema E-Cell Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • GPL
  • Prezzo:
  • FREE
  • Nome editore:
  • Kouichi Takahashi
  • Sito web dell'editore:

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Sistema E-Cell Descrizione

Un ambiente di modellazione e software di simulazione. Il sistema E-Cell è un concetto di costruzione di celle virtuali su computer. Il sistema cellulare è una suite software orientata agli oggetti per la modellazione, la simulazione e l'analisi dei sistemi complessi su larga scala come le cellule biologiche, architetti da Kouichi Takahashi e scritti da A Meraviglioso team di sviluppatori. Parte centrale del sistema, Ambiente di simulazione della cellula elettronica versione 3, consente a molti componenti guidati da più algoritmi con diversi interruzioni di tempo a Coexist.e-Cell Project è un progetto di ricerca internazionale che mira allo sviluppo di supporti teorici necessari, tecnologie e piattaforme software per consentire precise Simulazione intera cella Simulation.e-Cell System è composta dalle seguenti tre parti principali: - Ambiente di simulazione delle cellule elettroniche (o E-cell SE) - Ambiente di modellazione delle cellule elettroniche (o e-cella ME) - Ecco i toolkit di analisi delle cellule elettroniche Alcune caratteristiche chiave del "Sistema E-Cell": Capacità di base: · Modellazione orientata agli oggetti e simulazione di sistemi complessi. · Architettura plug-in. Nuove classi dell'oggetto utente possono essere sviluppate, caricate dinamicamente e utilizzate nella simulazione. · Interazione utente e visualizzazione dell'utente in tempo reale durante la simulazione. Scripting: · Scripting Python di una sessione di simulazione (esecuzione / arresto / manipolazione parametri / elaborazione dati ecc ...). · Scripting Python di un esperimento di simulazione che coinvolge molte corse delle sessioni di simulazione (come la sintonizzazione dei parametri, l'analisi del controllo metabolico ecc.) · Scripting Python della generazione di file del modello (ad esempio per la costruzione automatica del modello da banche dati). Compatibilità: · SBML Livello 1/2 Importazione. · Esportazione di livello SBML 1/2. Calcolo parallelo: · Memoria condivisa, parallelizzazione multi-thread di una singola sessione di simulazione. (da fusrsi nel ramo principale.) · Cluster e Grid Distributed Computation di più sessioni di simulazione. Motore di griglia solare, (Globus Toolkit). Cosa c'è di nuovo in questa versione: · Risolto un bug in ecell.session.saveloggerdata (). (Moriyoshi) · Risolto un bug in ecell.ecddatafile. (Moriyoshi)


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