Seedwatersescripmenter. Un programma grafico Python per segmentare interattivamente le pile di celle di celle in tessuto con etichette ed etichette
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Seedwatersescripmenter. Classifica e riepilogo

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Immagine segmento pile

Seedwatersescripmenter. Descrizione

SeedWaterseTeGrementer è uno strumento grafico Python per segmentare interattivamente pile di celle di celle in tessuto con etichette ed etichette (alias. Contorni bianchi). Le interazioni sono interamente basate sulla modifica dei semi, che a loro volta vengono ampliati da un algoritmo spartiacque. La principale differenza tra SWS e altri strumenti è che è possibile posizionare più di un seme per cellulare che può aiutarti a regolare i confini delle celle difficili. ISWSSWS è costruito in cima a Wxpython, Matplotlib, Numpy, Scipy e Mahotas.at il suo nucleo , utilizza un algoritmo di spartiacque fulminea (grazie al progetto Mahotas) e consente aggiornamenti in tempo reale. Ha un semplice (se ingombrato) ui ed è completamente interattivo, anche incluso un annullamento di 1 livello. La pubblicazione su SWS che dà tutti questi dettagli e altro in citometria parte A: http: //onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002 /Cyto.a.22034/absactactource code è rispecchiato a quattro repository e in Pypi: - GitHub: http://github.com/davidmashburn/seedwatersescripmenter/- Bitbucket: http://bibucket.org/davidmashburn/seedwatersescripment- Gitous: http://gitorious.org/seedWatersersegmenter- Google Codice: http://code.google.com/p/seedwater/- Pypi: http://pypi.python.org/pypi/seedwatersescripmenterLa pagina del codice Google ha anche un po 'di binario Rilasci (http://code.google.com/p/seedwater/) che dovrebbe funzionare su Windows a 32 bit o Linux a 64 bit, ma questi sono ormai vecchi. Si prega di utilizzare il metodo "Easy_Install" ora. Per ulteriori dettagli, vedere ISTRUZIONI PER L'INSTALLAZIONE PYTHON 20XX.TXT È inoltre necessario leggere il manuale: Seedwater Segmenter V XX manuale.Txtstalling e runningstalling è finalmente facile! In effetti, ora puoi "Easy_install SeedWaterseGrementer "Istruzioni rapide: Windows / Mac: installare Gestione di Python Distribuzione http://www.thenthought.com/products/edudownload.phpubuntu/debian: sudo apt-get install python-setuptools python-wxtools Python-Numpy Python-Scipy Python- MATPLOTLIB Python-imaging Python-XLRD Python-XLWTIN Una finestra CMD (deve funzionare come amministratore sotto Windows Vista / 7) o terminale (Mac / Linux), eseguire: Easy_install Mahotas cmpgen ellipsefitter filesamesort enbiffloader imageContour SeedwatersegmenterDetailed Istruzioni: L'ultima versione è chiamata: "Python install istruzioni agosto 2012.txt" https://github.com/davidmashburn/seedwatersersegmenter/blob/master/python istruzioni di installazione Agosto 2012.TsxtProduct homepage

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