Malva Costruisce gli allineamenti multipli globali delle sequenze del genoma riorganizzate
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Costruisce gli allineamenti multipli globali delle sequenze del genoma riorganizzate Il progetto MAUVE è un sistema per costruire in modo efficiente più allineamenti al genoma multiplo in presenza di eventi evolutivi su larga scala come il riarrangiamento e l'inversione. L'allineamento del genoma di grandi dimensioni fornisce una base per la ricerca sulla genomica comparativa e lo studio delle dinamiche evolutive su una nuova scala. Allineamento di tutti i genomi è un problema fondamentalmente diverso rispetto all'allineamento di sequenze brevi. Mauva è stata sviluppata con l'idea che un allineamento del genoma multiplo dovrebbe richiedere solo modeste risorse computazionali. Impiega tecniche algoritmiche che si adattano bene nella quantità di sequenza che sono allineate. Per esempio, un paio di Genomi di Y. Pestis possono essere allineati in meno di un minuto, mentre un gruppo di 9 genomi enterobatteri divergenti può essere allineato in poche ore.

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