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Insilicospectro :: Insilico :: MSMSoutput Descrizione

Insilicospectro :: Insilico :: MSMSMoutput è un oggetto che implementa i metodi di visualizzazione / uscita comuni per le masse. Insilicospectro :: Insilico :: MSMSMoutput è un oggetto Implementazione di metodi di visualizzazione / uscita comuni per le masse.attributesspectruma Riferimento a un hash come calcolato da Masscalculator :: GetFragmentmasses o un oggetto di msmsheospecttrum.expspectruma Riferimento a uno spettro sperimentale come richiesto da Masscalculator :: matchclosest o un oggetto di classe expectrum. Quando questo parametro è specificato, il costruttore si suppone che lo spettro di hash contiene dati sulla corrispondenza con questo spettro sperimentale.massindexLe indice di massa nei vettori di picco sperimentale, predefinito 0. Se ExpSpectrum Parameter è un oggetto ExpSpectrum Questo indice viene letto direttamente dall'oggetto .intensityindexLe indice di intensità nei vettori di picco sperimentale, predefinito 1. Se il parametro ExpSpectrum è un oggetto ExpSpectrum in questo indice viene letto dall'oggetto direttamente. Tolleranza di errore di massa di massa; Questo parametro è facoltativo. Quando non specificato, le masse abbinate trovate dall'algoritmo di corrispondenza sono tutte conservate. Se specificato, viene applicata la nuova tolleranza. Questo parametro è utile principalmente per la corrispondenza ottenuta tramite Matchspectrumclosest che non applica alcuna tolleranza di massa. Errore di massa di massa. Errore di massa, valore predefinito 0,2 DA. Questo parametro viene utilizzato solo nel parametro Case Tol viene specificato, vedere sopra.inselthis Parameter controlla il modo in cui le intensità di picco sono normalizzate, vedere la funzione normalizeintensities.Parameter Intsel viene utilizzato in dotazione ExpSpectrrum è stato set.Precthe Numero di cifre dopo i punti decimali per le masse. La precisione predefinita è di 3 cifre.ModiflvlControls Come le modifiche sono evidenziate nel vettore SPRICKPEPT Definito di seguito, vedere anche Funzione ANNOTATEPET.CMPTHIS Parametro è un riferimento a una funzione di confronto utilizzata per l'ordinamento dei nomi di frammento. Se CMP non è impostato, viene utilizzata invece la funzione cmpfraggypes. Requisiti: · Perl.

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