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BIO :: POPGEN :: Modulo Htsnp.pm può selezionare HTSNP da un set di aplotipo. BIO :: POPGEN :: Modulo Htsnp.pm può selezionare Htsnp da un set di haplotipo .synopsis Utilizzare Bio :: Popgen :: Htsnp; My $BJ = BIO :: POPGEN :: HTSNP-> NUOVO ($ Hap, $ SNP, $ POP); Selezionare il minimo Set di SNP che contiene le informazioni complete sull'aplotipo senza ridondanti.Take come ingresso i valori followin: - il blocco di aplotipo (array di array). - L'ID SNP (array). - Informazioni sulla famiglia e frequenza (array di array). L'ultimo aplotipo viene generato in un formato numerico e i set di SNP possono essere recuperati dal modulo.considerazioni: - Se si forza per includere una famiglia con indeterminazione, lo SNP con indeterminazione verrà rimosso dall'analisi, quindi considerare prima di posizionare il tuo Set di dati Che cosa vuoi veramente fare.- Se due famiglie hanno le stesse informazioni (Haplotipo identico), una delle quali verrà rimossa e i file rimossi verranno memorizzati classificati come rimossi.- Sono accettati solo per il calcolo A, C, G, T e - (come cancellazione) e le loro combinazioni. Qualsiasi altro valore come n o? sarà considerato come degenerazioni a causa della mancanza di informazioni. Requisiti: · Perl.

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