Bio :: Nexus :: taxablock BIO :: NEXUS :: taxAblock è un modulo perl che rappresenta taxa blocco di un file nexus.
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Bio :: Nexus :: taxablock Classifica e riepilogo

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bloccare modulo Perl File di Nexus. blocco TAXA TAXA

Bio :: Nexus :: taxablock Descrizione

Bio :: Nexus :: taxAblock è un modulo perl che rappresenta taxa blocco di un file nexus. BIO :: Nexus :: taxablock è un modulo perl che rappresenta taxa blocco di un file nexus.synopsis se ($ tipo = ~ / taxa / i) {$ block_object = new bio :: nexus :: taxablock ($ tipo, $ blocco , $ verbose); } Se un blocco nexus è un taxa blocco, questo modulo analizza il blocco e memorizza i dati tassonomici.MethodsNew Titolo: Nuovo utilizzo: block_object = New Bio :: Nexus :: taxAblock ($ BLOCK_TYPE, $ comandi, $ Verbose); Funzione: crea un nuovo BIO :: Nexus :: TAXABLOCK Object Returns: Bio :: Nexus :: TaxAblock Object Args: Type (String), i comandi / commenti a Parse (array ref) e un flag verbose (0 o 1; Facoltativo) IS_TAXON Titolo: IS_TAXON UTILIZZO: $ BLOCK-> IS_TAXON ($ query_taxonlabel); Funzione: convalida nomi OTU / taxlabels restituisce: restituisce taxlabel se true, undef se falso args: query taxon italgget_ntax Titolo: Get_NTAX Uso: $ BLOCK-> Get_NTAX (); Funzione: restituisce le dimensioni (cioè Ntax) del blocco restituisce: Dimensioni (Integer) ARGS: NEEREENAME_OTO Titolo: RENAME_OTO Uso: $ BLOCK-> RENAME_OTO (% Traduzione); Funzione: Rinomina tutti gli OTUS per qualcos'altro ritorna: Nessuno ARGS: hash contenente tasse di traduzione Nome: equivale a utilizzare: $ taxa-> uguale ($ un altro); Funzione: confronta se due Bio :: Nexus :: TaxAblock Objects è uguale rendimento: boolean args: A BIO :: Nexus :: TaxAblock Object Requisiti: · Perl.

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