Bio :: Nexus :: UnalignedBlock BIO :: NEXUS :: UNALLEGNEDBLOCK è un modulo Perl che rappresenta un blocco non allineato di un file Nexus.
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bloccare modulo Perl File di Nexus. blocco UNALIGNED Non allineato

Bio :: Nexus :: UnalignedBlock Descrizione

BIO :: NEXUS :: UnalignedBlock è un modulo perl che rappresenta un blocco non allineato di un file Nexus. BIO :: NEXUS :: UNALLEGNEDBLOCK è un modulo Perl che rappresenta un blocco non allineato di un file nexus.synopsis se ($ tipo = ~ / non allineato / i) {$ block_object = new bio :: nexus :: unignedblock ($ tipo, $ blocco, $ verbose); } Questa è una classe che rappresenta un blocco non allineato in Nexus FileMethodsNew Titolo: Nuovo utilizzo: Block_Object = New Bio :: Nexus :: UnalignedBlock ($ BLOCK_TYPE, $ comandi, $ Verbose, $ taxlabels); Funzione: crea un nuovo BIO :: Nexus :: UnignedBlock Object Returns: Bio :: Nexus :: Oggetto non allineato ARGS: digita (stringa), i comandi / commenti a Parse (array ref) e un flag verbose (0 o 1) Trova_taxon Titolo: find_taxon Uso: My $ IS_TAXON_PRESENT = $ SELF-> find_taxon ($ taxon_name); Funzione: trova se il nome del taxon in ingresso è presente nell'etichetta dei taxon. Restituisce: 0 (non presente) o 1 (se presente). ARGS: taxon etichetta (come stringa) set_format Titolo: set_format Uso: $ BLOCK-> Set_Format (% formato); Funzione: Imposta il formato dei ritorni dei caratteri: Nessuno ARGS: Hash of Format Valsget_Format Titolo: Get_Format Uso: $ BLOCK-> Get_Format (); Funzione: restituisce il formato dei ritorni dei caratteri: i valori di formato di formato ARGS: NOTISET_OTUSET Titolo: Set_oTuset Uso: $ BLOCK-> Set_OTuset ($ Otuset); Funzione: impostare i rendimenti OTUS: Nessuno ARGS: TaxUnitset ObjectSet_CHarStateLabels Titolo: Set_charStateLabels Utilizzo: $ BLOCK-> Set_CharStateLabels ($ etichette); Funzione: Imposta i nomi dei caratteri e gli Stati ritorni: Nessuno ARGS: array di caratteri statisget_charatelabels Titolo: Get_charStateLabels Utilizzo: $ set-> get_charatelabels (); Funzione: restituisce una serie di stati di carattere restituisce: Destinatari ARGS: NomeGet_NTAX Titolo: Get_NTAX Uso: $ BLOCK-> Get_NTAX (); Funzione: restituisce il numero di taxa dei ritorni del blocco: # taxa args: nyerename_otus Titolo: RENAME_OTO Uso: $ BLOCK-> RENAME_OTO (% Traduzione); Funzione: Rinomina tutti gli OTUS a qualcos'altro ritorna: nessuno args: hash contenente tambanceria Nome: equivale a utilizzare: $ block-> uguale a ($ un altro); Funzione: confronta se due Bio :: Nexus :: Oggetti UNALIGNEDBLOCK sono uguali rendimenti: boolean args: A BIO :: Nexus :: Personaggi Blocchi Requisiti dell'oggetto: · Perl.

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