Bio :: Nexus :: DistancesBlock BIO :: Nexus :: DistancesBlock è un modulo Perl che rappresenta il blocco di distanze nel file Nexus.
Scarica ora

Bio :: Nexus :: DistancesBlock Classifica e riepilogo

Bio :: Nexus :: DistancesBlock Tag

bloccare modulo Perl File di Nexus. Blocco distanze DISTANZE

Bio :: Nexus :: DistancesBlock Descrizione

Bio :: Nexus :: distancesblock è un modulo perl che rappresenta il blocco di distanze nel file Nexus. BIO :: Nexus :: DistancesBlock è un modulo Perl che rappresenta le distanze Block nel file Nexus. La classe DistancesBlock rappresenta un blocco di distanze Nexus e fornisce metodi per la lettura, la scrittura e l'accesso ai dati all'interno di questi blocchi. Le distanze i blocchi contengono matrici di distanza o una tabella di distanze calcolate tra ogni possibile coppia di taxa.methodsnew Titolo: Nuovo utilizzo: Block_Object = New Bio :: Nexus :: DistancesBlock ($ BLOCK_TYPE, $ comandi, $ Verbose, $ taxa); Funzione: crea un nuovo BIO :: Nexus :: DistancesBlock Object Returns: Bio :: Nexus :: DistancesBlock Object Arts: Type (stringa), i comandi / commenti a Parse (array ref) e un flag verbose (0 o 1) Get_Matrix Titolo: Get_Matrix Uso: $ Matrix = $ Self-> Get_Matrix (); Funzione: recupera l'intera restituzione della matrice di distanza: un hashref di Hashrefs args: nessuno NOTA: i valori della distanza possono essere recuperati specificando i tasti di riga e colonna, ad es. $ dist = $ matrice -> {$ row_taxon} {$ col_taxon} get_distances_fort Titolo: get_distances_fortifage:% taxon1_distances =% {$ self-> get_distances_for ($ first_taxon)}; Funzione: recupera una riga della matrice di distanza Ritorna: args: l'etichetta della riga (un taxlabel) per la riga desiderata (stringa) Get_distance_between Titolo: Get_distance_between Uso: $ Distanza = $ Self-> Get_Distance_between ($ Row_TAXON, $ COLLING_TAXON); Funzione: recupera una cella da Matrix Returns: un argomento scalare (numero): le etichette righe e colonne (entrambe taxa) per la cella desiderata Nota: generalmente get_distance_between ($ A, $ B) == get_distance_between ($ B, $ a ); Tuttavia, questo non è necessario essere true se la matrice di distanza non è simmetrica. Assicurati di chiedere la distanza che desideri. Requisiti: · Perl.

Bio :: Nexus :: DistancesBlock Software correlato