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BIO :: Strumenti :: Run :: PisaApplication :: Align2Model è una classe Bioperl per Align2Model - Crea un più allineamento di sequenze ... Bio :: Strumenti :: Run :: PisApplication :: Align2Model è una classe Bioperl per Align2Model - Creare un più allineamento di sequenze su un modello esistente. Apparametri: ALING2Model (stringa) Esecuzione (stringa) Run Nome DB (sequenza) sequenze per allinearsi (-db) modello_file (infle) modello (-i) tubo: sam_model id (stringa) sequenza identificativo (s) Selezione (separata da virgole) (-ID) NSCORESEQ (Integer) Numero massimo di sequenze da leggere (-nscoreseq) AdpStyle (escl) Stile di programmazione dinamico (-Adpstyle SW (escl) Sequenza sequenza sequenza (-SW) AUTO_FIM (Switch) Aggiungi Fims Automaticamente (-Auto_FIM) Jump_in_Prob (Float) Costo della probabilità di saltare al centro del modello (-Jump_in_Prob) Jump_out_Prob (Galleggiante) costo di probabilità di saltare fuori dal centro del modello (-jump_out_prob) A2MDOTS (interruttore) Stampa punti per riempire la necessità dello spazio per gli inserimenti di altri sequenze (-a2mdots) Dump_parameters (escl) (-Dump_Parameters) Requisiti: · Perl.

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