Ambiente di simulazione di elettrofisiologia cellulare L'ambiente di simulazione di elettrofisiologia cellulare è un ambiente di simulazione per elettrofisiologia.
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Ambiente di simulazione di elettrofisiologia cellulare Classifica e riepilogo

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Ambiente di simulazione di elettrofisiologia cellulare Descrizione

L'ambiente di simulazione di elettrofisiologia cellulare è un ambiente di simulazione per elettrofisiologia. Ambiente di simulazione di elettrofisiologia cellulare (CESE) è un quadro completo specificamente progettato per eseguire simulazioni elettrofisiologiche computazionali, ad esempio, le simulazioni del miocyte cardiaco Attività elettrica.Cell Ambiente di simulazione di elettrofisiologia è utile per simulazioni di potenziali di azione, singole correnti ioniche e cambiamenti nelle concentrazioni ioniche .Chese è un programma multipiattaforma, funziona su qualsiasi sistema che ha Java Runtime Environment (JRE) versione 1.4 o superiore. È stato testato su Windows, Linux, Solaris, MacOS X e Aix.CseseSceseScese è un ambiente integrato per l'esecuzione di simulazioni computazionali utilizzando una varietà di modelli elettrofisiologici. In questa fase CESE consente la creazione e l'esecuzione dei modelli a cellule singole (contenenti entrambi Hodgkin-huxley (HH) e formulazioni attuali di Markovian). I modelli di attività elettrica dei miociti cardiaci con il codice sorgente sono inclusi nella distribuzione della CESE. Speriamo di estendere il numero di modelli disponibili e aggiungere determinati modelli neuronali in futuro. La forza principale della CESE è nella sua uniformità un'interfaccia del programma rimane la stessa per diversi tipi di modelli. È possibile apportare facilmente i modelli e confrontare le uscite di simulazione. I parametri del modello possono essere modificati, selezionati per l'output e / o bloccati nello stesso modo standard. Esese estende il significato elettrofisiologico convenzionale del "morsetto di tensione". È possibile bloccare praticamente qualsiasi variabile del modello, compresa la tensione (potenziale di membrana), le correnti ioniche totali o singole, concentrazioni ioniche, concentrazioni ioniche, temperatura, variabili di gating, ecc. I comandi di serraggio possono essere funzioni complesse di pezzi, impostati individualmente per la variabile del modello di interesse . Ciò apre infinitamente possibilità per l'esplorazione del complesso comportamento del modello.Cese fornisce visualizzazioni di dati semplici, ma efficienti. I risultati della simulazione possono essere presentati nei moduli grafici e tabulato. I grafici possono essere personalizzati e le regioni di interesse zoomed.even Sebbene Cese non sia stato progettato per essere uno strumento di analisi dei dati, è possibile generare relazioni di tensione di corrente (I-VS) e calcolare i parametri statistici per un determinato segnale all'interno del programma. È possibile esportare i tuoi dati in ASCII, Axon Text File (ATF) e i formati di NetCDF per continuare l'analisi nel tuo pacchetto preferito. Gli sviluppatori di sviluppo è stato creato da terra per incorporare le migliori pratiche di programmazione disponibili per gli sviluppatori Java, sia in termini di utente Interfaccia Consistenza e chiarezza del codice e riutilizzo. Ove possibile, Cese si affidano a API disponibili Java (ad esempio Java2D, Javabeans, Jaxp) per semplificare il codice. La creazione di Godel richiede un numero di funzioni di manutenzione della casa da codificare queste includono integratori ODE, routine per la gestione dei parametri del modello, risparmio / Ripristino dello stato del modello, visualizzazione dei risultati di simulazione, ecc. Cese ti fornisce l'implementazione per queste routine, quindi, è possibile concentrarsi sulla scrittura del codice per la / i relativa / i ionica (i) in calcestruzzo, e la CESE gestirà il resto.CESE non sta cercando di creare complicato Strutture di programmazione da solo piuttosto, utilizza le API Java Core. Ad esempio, i modelli sono componenti Java conforme alla specifica dei JavaBeans. Utilizziamo XML per specificare i comandi di serraggio e la serializzazione dell'oggetto Java per salvare / ripristinare i parametri del modello. Che cosa è nuovo in questa versione: · Questa versione aggiunge una GUI per cambiare i tipi di stampa, migliora le prestazioni e contiene diversi bugfix importanti.

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