qpure. Strumento per valutare la cellularità del campione tumorale da array SNP
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qpure. Classifica e riepilogo

qpure. Tag

Snp.

qpure. Descrizione

QPURE è sviluppato come pacchetto R accessibile e pratico che consente di stimare la purezza o la cellularità del tumore utilizzando i dati del polimorfismo single-nucleotidico (SNP) da campioni accoppiati tumori / normali. I vantaggi dell'utilizzo del metodo QPure per la stima della cellulalarità del tumore è che è un approccio statistico imparziale che misura direttamente il contenuto del tumore dal campione che il DNA è stato estratto. Il nostro recente studio (manoscritto in preparazione) suggerisce che il metodo QPure è uno strumento essenziale per stimare la cellularità del tumore prima di eseguire il sequenziamento ad alto throughput sui campioni di cancro. Questa vignetta offre un'introduzione in stile tutorial alla funzione nel pacchetto QPure. Le funzioni forniscono il punteggio QPure per ciascun campione dato il loro genoma-wide snp pro les come Generato da chips Illumina SNP.

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