iLAP. Un'applicazione che combina lo sviluppo sperimentale del protocollo con analisi dei dati correlati a micro-biologia in un unico sistema integrato
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iLAP. Descrizione

Biologia moderna Confrontare gli scienziati con la sfida scoraggiante di conservare i dati eterogenei in modo strutturato e organizzato. Tra le soluzioni di gestione dei dati disponibili non vi è alcun sistema intuitivamente utilizzabile che copre il flusso di lavoro completo degli esperimenti di microscopia. ILAP (Gestione dei dati di laboratorio, analisi e sviluppo del protocollo) è un software che è stato creato per fornire una soluzione che combina lo sviluppo sperimentale del protocollo, l'acquisizione dei dati basata sulla procedura guidata e l'analisi dei dati ad alta velocità in un unico sistema integrato. Una caratteristica unica di ILAP è che supporta la fase di progettazione sperimentale. I protocolli di lavoro che gli scienziati si sviluppano per gli esperimenti di laboratorio bagnati possono essere memorizzati e modificati all'interno di ILAP. Alla fine, questi protocolli portano all'acquisizione dei dati dell'immagine. ILAP quindi fornisce una procedura guidata di acquisizione dati per assistere lo scienziato nell'associazione dei dati di immagine acquisiti con passaggi nel protocollo. Le iniziative di standardizzazione, come il pesca di pesca per l'ibridazione di fluorescenza del DNA, possono essere supportate applicando l'input dei parametri richiesti durante questa acquisizione dei dati. Ulteriore elaborazione e analisi dei dati di immagine raw possono essere eseguiti con moduli di analisi sviluppati specificamente all'interno di ILAP o con programmi di terze parti esterne. Le interessanti osservazioni visive possono essere documentate come note in qualsiasi luogo. ILAP è un progetto open source che è liberamente disponibile per la comunità di microscopia. È stato testato ampiamente nella nostra struttura di microscopia interna e il feedback continuo degli utenti ha portato a miglioramenti in funzionalità, usabilità e reattività. Una virtù distintiva di ILAP è che conduce intrinsecamente alla registrazione strutturata di esperimenti, conservando il completo contesto sperimentale dei record di dati in tutta la storia del progetto di ricerca.

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