Wquant. Algoritmo di quantificazione a base di wavelet per ITRAQ
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Wquant. Classifica e riepilogo

Wquant. Tag

segnale ione

Wquant. Descrizione

WQuant è un algoritmo che utilizza un'analisi basata su wavelet per identificare ed estrarre i segnali ioni di reporter ITAQUE per ottenere quantificazione. È anche una parte integrativa della pipeline di analisi dei dati MS OCAP. Il programma è stand-alone e non richiede alcun processo di installazione separato. Si prega di estrarre semplicemente il programma ed eseguire "wquant.exe". Il programma è compilato in C ++ in Microsoft Windows, utilizzando Visual Studio 2008. La libreria di runtime Visual Studio 2008 C ++ è necessaria per eseguire il programma. Wquarant ha 5 parametri e la sintassi è: Wquant.exe · File spettri]: percorso completo e nome del file Spectra in formato MGF. · File dei risultati in tandem]: percorso completo e nome dell'output da x! Tandem. · Multiplex ITRAQ]: esperimento a 4 plex o un esperimento a 8 plex, "4" o "8". · X! Tandem E-Score Cutoff]: cutoff di identificazione per quantificazione. · Metodo di quantificazione]: 3 modi per calcolare l'intensità degli ioni: "intensità", "trapezoide" e "Auc" l'area sotto la curva.

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