Vongole Classificare le sequenze con questo strumento.
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Vongole Classifica e riepilogo

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Vongole Descrizione

Le vongloni è un'applicazione utile appositamente progettata per offrirti un classificatore basato sulla composizione della sequenza per sequenze metagenomiche. Le vongole funzionano catturando le firme di ciascuna sequenza in base alla composizione della sequenza. Ogni sequenza è modellata come una passeggiata in un grafico de Bruijn con le proprietà della catena di Markov sottostante. Le vongole catturano i parametri stazionari della catena di markov sottostante e parametri strutturali del grafico di sottostanti de Bruijn per formare questa firma. In pratica, per ogni sequenza da raccogliere, tale firma è calcolata e abbinata a firme simili calcolate per i set di formazione. La migliore corrispondenza che qualifica anche le vittorie di interruzione della distanza normalizzata. Nel caso in cui la corrispondenza migliore non si qualifichi questo cut-off, la sequenza rimane un-binned.

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