Vaporizzare Selezione dei modelli Best-Fit of Protein Evolution.
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simulazione in forma proteina Simulatore di evoluzione Evoluzione allineamento Identificazione delle proteine cristallizzazione delle proteine Traslocazione delle proteine Bontà della misura simulare l'evoluzione analizzare l'evoluzione Adatta l'apparecchio convalidare proteine regolamentate evoluzione degli organismi Evoluzione delle proteine Test di proteine Allineamento delle proteine dicroismo proteico Strutture proteiche Residui proteici Browser proteico visualizzare le proteine simulare l'evoluzione delle proteine Simulazione dell'evoluzione delle proteine Evoluzione convergente Evoluzione parallela MKDV Evolution. rendere le proteine Gestire la banca dati proteica VIZUualizer proteico

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ProTest (ModelTest's Relative) è un programma per selezionare il modello dell'evoluzione delle proteine che meglio si adatta a un determinato set di sequenze (allineamento). I modelli inclusi sono matrici di sostituzione empirica (come WAG, LG, MTREV, Dayhoff, DCMut, JTT, VT, Blosum62, CPREV, RTREV, MTMAM, Mtart, HIVB e HIVW) che indicano tassi relativi di sostituzione di aminoacidi e miglioramenti specifici (+ I: Siti invariabili, + G: Tariffa eterogeneità tra i siti, + f: frequenze amminoacidiche osservate) per tenere conto dei vincoli evolutivi impossi da conservazione della struttura e della funzione proteica. ProTest utilizza il criterio informativo AKaike (AIC) e altre statistiche (AICC e BIC) per trovare quale dei modelli candidati si adatta meglio ai dati a portata di mano. Dare a preparare un tentativo di valutare pienamente le sue capacità!

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