VMD Molecular. VMD è un programma di visualizzazione molecolare per la visualizzazione, l'animazione e altro ancora.
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VMD Molecular. Classifica e riepilogo

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VMD Molecular. Descrizione

VMD è progettato per la visualizzazione e l'analisi di sistemi biologici come proteine, acidi nucleici, assemblaggi di bilayer lipidici, ecc. Può essere utilizzato per visualizzare più molecole generali, poiché VMD può leggere File standard della banca dati di dati proteici (PDB) e visualizzano la struttura contenuta. VMD offre un'ampia varietà di metodi per il rendering e la molecola da colorare. VMD può essere utilizzato per animare e analizzare la traiettoria delle simulazioni di dinamiche molecolari (MD) e può manipolare in modo interattivo le molecole che vengono simulate su computer remoti (MD interattivo). Le caratteristiche principali di VMD includono: Supporto per tutte le principali piattaforme informatiche Supporto per i processori multicore Supporto per la GPU Computation accelerato Molti eccellenti tutorial VMD si sono sviluppati localmente e dalla comunità di ricerca in generale Nessun limite sul numero di molecole, atomi, residui o numero di fotogrammi di traiettoria, ad eccezione della memoria disponibile Molti metodi molecolari di rendering e colorazione Capacità di visualizzazione stereo Ampia sintassi della selezione Atom per la scelta dei sottoinsiemi di atomi per il display (include operatori booleani, espressioni regolari e altro) Supporto per oltre 60 formati di file molecolari e tipi di dati attraverso una vasta Biblioteca di plugin e traduttori di lettore di file integrato VMD include un plugin di allineamento di sequenze multiple, un ambiente di analisi dell'analisi bioinformatica unificata che consente di organizzare, visualizzare e analizzare sia i dati della sequenza che della struttura per proteine e acidi nucleici. Capacità di esportare la grafica visualizzata in file che possono essere elaborati da un certo numero di pacchetti di rendering di raggio di raggi popolari e di rendering di immagini, tra cui POV-Ray, Rayshade, Raster3D e Tachion. Interfacce utente grafiche e tecnologiche estensibili dall'utente, lingue di scripting TCL / TK e Python standard incorporati Estensioni alla lingua TCL che consentono ai ricercatori di scrivere le proprie routine per l'analisi molecolare

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