Sequenza breve Posizione Mapper

Un programma scritto per analizzare e visualizzare la posizione di brevi sequenze su una sequenza più ampia
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Sequenza breve Posizione Mapper Classifica e riepilogo

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  • Bas Pigmans
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Sequenza breve Posizione Mapper Tag


Sequenza breve Posizione Mapper Descrizione

Sequenza corta Posizione Mapper carica le sequenze, quindi li allinea e finalmente i grafici e le tabelle possono essere generati per uno o più set di dati contemporaneamente. SSLM funziona in genere con un file di output di Blast Data di Short Solexa Letture mappate su soggetti RNA (ad esempio Sequenze pre-MiRNA). L'analisi può essere eseguita su una sequenza nel set di dati o su diversi tipi di RNA. L'output generato è sullo schermo o in formato separato-, veloce, testo o TIFF. SSLM non eseguirà la ricerca di esplosioni per collegare le sequenze brevi a una sequenza più grande da cui provengono. Prendi la sequenza breve Posizione Mapper per un test drive per vedere cosa si tratta!


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