Seq Monk.

seqmonk è un programma per abilitare la visualizzazione e l'analisi dei dati di sequenza mappati. È stato scritto per l'uso con i dati della sequenza di nuova generazione mappati ma la teoria può essere utilizzata per qualsiasi set di dati che
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Seq Monk. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • GPL
  • Nome editore:
  • Babraham Bioinformatics
  • Sito web dell'editore:
  • http://www.bioinformatics.bbsrc.ac.uk
  • Sistemi operativi:
  • Windows All
  • Dimensione del file:
  • 2.1 MB

Seq Monk. Tag


Seq Monk. Descrizione

Uno strumento per visualizzare e analizzare i dati di sequenza mappati ad alto throughput SEQMONK è un programma per abilitare la visualizzazione e l'analisi dei dati di sequenza mappati. È stato scritto per l'uso con i dati della sequenza di nuova generazione mappati ma la teoria può essere utilizzata per qualsiasi set di dati che può essere espresso come una serie di posizioni genomiche. Le sue caratteristiche principali sono: * Importazione di dati mappati da dati mappati (BAM / SAM / Bowtie / MAQ ecc.) * Creazione di gruppi di dati per la visualizzazione e l'analisi * Visualizzazione delle regioni mappate contro un genoma annotato. * Quantizione flessibile dei dati mappati per consentire confronti tra set di dati * Analisi statistica dei dati per trovare regioni di interesse * Creazione di report contenenti dati e annotazione del genoma


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