Scanner di Arabidopsis Motif. Srevel Gene Relations e Funzioni.
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Scanner di Arabidopsis Motif. Classifica e riepilogo

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Scanner di Arabidopsis Motif. Descrizione

Arabidsis Motif Scanner (AMS) è un'applicazione Windows che funziona sui computer locali. È stato sviluppato per costruire reti geniche identificando le posizioni degli elementi normativi della CIS nell'impianto del modello Arabidopsis Thaliana e fornendo un'interfaccia facile per valutare e valutare le relazioni geniche. La sua principale caratteristica innovativa è combinare le posizioni dell'elemento di normativa CIS, le NGS e gli array dei trucioli DNA dati di espressione, le annotazioni di Arabidopsis e le interazioni genetiche per l'identificazione delle reti geni regolate dai fattori di trascrizione. Negli studi focalizzati sulla funzione dei fattori di trascrizione, il software utilizza i dati di espressione e i motivi del sito legante nelle regioni del gene regolativo per predire i geni di destinazione diretta. Inoltre, AMS utilizza i dati di interazione del DNA-Protein e ProteinProtein per facilitare l'identificazione dei percorsi metabolici regolati dal fattore di trascrizione degli interessi.

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