Satlotyyper.

inferenza di aplotipo da dati SNP non sfacciati in Polyploids eterozigoti basati su Sat
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Satlotyyper. Classifica e riepilogo

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Satlotyyper. Tag


Satlotyyper. Descrizione

Satlotyyper è uno strumento software progettato per inferire gli aplotipi da dati SNP in poliofini e poliallelici. Satlotyyper utilizza operatori e variabili booleani per formulare l'inferenza di aplotipo da puro parsimonia (Hipp) per il problema della soddisfazione booleana (SAT). Per trovare il set più parsimonioso di spiegare gli aplotipi, il satlotiyper inizia a presumere uno che spiega haplotipo e aumenta il numero di haplotipi fino a quando non viene trovato un set soddisfacente. Dato che SAT è NP-Complete, non può essere garantito che una soluzione si trova in tempo ragionevole per un determinato dato. Tuttavia, i test empirici hanno dimostrato che è possibile calcolare le inferenze per i dati dal mondo reale. Inoltre, il satlotiyper dà vincoli per le soluzioni di spiegazione alternative ed è in grado di ottimizzare la probabilità del risultato mediante una procedura di bootstrapping. Dare Satlotyper un tentativo di vedere quanto può essere in realtà per te!


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