STC.

Clustering TRIPLET più breve
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STC. Classifica e riepilogo

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  • By Nelson Software
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  • Windows 95, Windows 98, Windows Me, Windows, Windows XP, Windows NT, Windows 2000, Windows 3.x
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  • Windows 3.x/95/98/Me/NT/2000/XP, Excel 97
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STC. Tag


STC. Descrizione

Il nome STC sta per il più breve clustering triplet. Proponiamo un nuovo metodo di clustering basato sulla distanza, l'algoritmo del clustering triplet (STC), per ricostruire i filogeni. L'idea principale è l'introduzione di una definizione naturale di cosiddetti serie K-rappresentative. Sulla base di serie K-rappresentative, vengono ricostruite le terzine più brevi e servono come blocchi di costruzione per l'algoritmo STC alle sequenze di agglomerazione per la ricostruzione degli alberi in O (N ^ 2) tempo per n sequenze. Le simulazioni con set di dati da 500, 1000 e 5000 sequenze mostrano che STC offre una migliore precisione topologica rispetto ad altri metodi testati.


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