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 | Quasirecomba.Genera e analizza le quaspecie virali sottoposte alla ricombinazione. |
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Quasirecomba. Classifica e riepilogo
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- Licenza:
- Freeware
- Prezzo:
- Free
- Nome editore:
- By Armin Topfer
- Sistemi operativi:
- Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP
- Requisiti addizionali:
- Java
- Dimensione del file:
- 8.9 MB
- Download totali:
- 30
Quasirecomba. Tag
Quasirecomba. Descrizione
QuasiRecomb è un'applicazione leggera che corre nella console di comando , la simulazione di un modello di Markov per la generazione di quasispecie virali . Esso descrive la generazione di quasispecie virali e un metodo per dedurre i parametri analizzando i dati di sequenziamento di prossima generazione . Il modello è validato su dati simulati , che mostra il vantaggio di prendere in modo esplicito il processo di ricombinazione in considerazione , e testato applicando a letture ottenute da campioni sperimentali di HIV . Esso offre un'implementazione dell'algoritmo EM per trovare la massima a posteriori stime dei parametri del modello e un metodo per stimare la distribuzione dei ceppi virali nei quasispecie .
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