I ProFdists offre un quadro filogenetico che utilizza strutture secondarie delle singole RNA nella ricostruzione di filogeni basata su allineamenti alla struttura in sequenza, utilizzando il profilo del Neighborn Joint (PNJ) con definizione manuale o iterativa e automatica. Inoltre, Proffdists è un software accessibile e user-friendly che può anche affrontare sequenze proteiche.
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