Phylod. Componente di strumenti di Biologia Computational Microsoft
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Phylod. Classifica e riepilogo

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Phylod. Descrizione

I patogeni vivono e si riproducono all'interno dell'host umano, il cui sistema immunitario cerca continuamente di liberare il corpo di questi patogeni. Ciò porta ad un tiro al tirata tra il patogeno e l'host umano, dove il patogeno cerca di adattarsi per "fuggire" il sistema immunitario, mentre il sistema immunitario impara a riconoscere ed eliminare nuovi agenti patogeni stranieri. Una serie di giocatori chiave per il sistema immunitario sono le proteine HLA, ognuna delle quali può riconoscere specifici brevi frammenti di proteine straniere (ad esempio HIV), chiamate epitopi, in cellule infette e avvisano il sistema immunitario alla loro presenza. Per i patogeni in rapida evoluzione come l'HIV, un meccanismo di difesa chiave è quello di evolvere le mutazioni che impediscono alle proteine HLA di riconoscere il DNA virale. Questa evoluzione avviene di nuovo in ogni paziente, poiché ogni paziente ha un insieme diverso di proteine HLA che riconoscono epitopi differenti. Phylod è uno strumento statistico che può identificare le mutazioni dell'HIV che sconfiggono la funzione delle proteine HLA in alcuni pazienti, consentendo così al virus di sfuggire all'eliminazione dal sistema immunitario. Applicando questo strumento a grandi studi di pazienti infetti, i ricercatori sono ora in grado di iniziare a decodificare le regole complesse che governano le mutazioni dell'HIV, nella speranza di un giorno creando un vaccino a cui il virus non è in grado di sviluppare la resistenza. L'applicazione pre-compilata PhyLod è una parte del pacchetto di strumenti di Biologia di Microsoft Computational Biology. Requisiti: · Quadro netto

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