Phere. Ricerche sulle sequenze del genoma batteriofagio per blocchi che visualizzano la somiglianza della sequenza.
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Phere. Classifica e riepilogo

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ricercatore Asieme di formalità di colore somiglianza Saliente somiglianza variabile Genome Browser Annota il genoma Visualizza il genoma genoma vista la somiglianza visualizzazione della sequenza di immagini la ricerca del genoma sequenza genoma ricercatore sequenza Trova la sequenza del genoma batteriofago analizzare il genoma Analisi del genoma Visualizza più genoma Cerca genoma Visualizza la sequenza del genoma Viewer Sequence Genome. Visualizza la sequenza del genoma Visualizza i dati del genoma. sfogliare il genoma Visualizza il genoma linguaggio del genoma algoritmo di somiglianza del testo Genoma procariotico Analisi del genoma di Arabidsis. Visualizza il genoma di Arabidopsis. Analizza il genoma di Arabidopsis. Analizza il genoma batterico Visualizzazione del genoma Viewer del genoma Associazione Genome-Wide somiglianza sorta SEQUENZA SALESE. confrontare genoma sequenza Confronto della sequenza del genoma Sequenza del genoma Traccia del browser del genoma UCSC Visualizza il file del genoma Visualizza i dati del genoma Sequenza del genoma batterico. Genome Explorer. genoma microbico. caratterizzare il genoma Caratterizzazione del genoma Visualizza il genoma batterico Ambientazione somiglianze percentuale di somiglianza somiglianza visiva

Phere. Descrizione

Il programma PHIRE, un programma standalone in Visual Basic, esegue una ricerca basata sulla stringa algoritmica sulle sequenze del genoma batteriofagio, alla scoperta ed estrazione di blocchi che visualizzano la sequenza di somiglianza, corrispondenti agli elementi normativi conservati contenuti in questi genomi in modo sistematico, senza alcun previo sperimentale o conoscenza predittiva Phire confronta sistematicamente tutte le sottostringhe del DNA di una lunghezza specificata (l) l'una all'altra, consentendo un numero limitato di disallineamenti (degenerazione d) di ordinare ed estrarre i set più grandi (dominantnum) di sottostringhe che rappresentano un consenso unico. In questo modo, l'intero genoma sarà analizzato anche su Watson e Crick DNA Strand. Per visualizzare le sequenze attorno alla sequenza di consenso, la dimensione della finestra (W) può essere adattata per includere le sequenze a sinistra ea destra di ciascuna stringa individuale del DNA selezionata.

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