Bowtie è un software di allineamento a breve termine a memoria ultrapposizione, progettato per allineare le sequenze di DNA corta (letture) al genoma umano ad un tasso di circa 25 milioni di letture all'ora su una tipica workstation con 2 gigabyte di memoria. Ora puoi utilizzare questo strumento basato sulla riga di comando per allineare rapidamente le sequenze del DNA. È inoltre possibile creare file batch per eseguire le operazioni che richiedono più parametri. Bowtie supporta anche le modalità di allineamento locali, gappate e accoppiate.
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