Ostay. Classifica e riepilogo
- Nome editore:
- Daniel C. Richter
- Sistemi operativi:
- Windows All
- Dimensione del file:
- 2.8 MB
Ostay. Tag
Ostay. Descrizione
Oslay è un comodo pezzo di software progettato per utilizzare la sintimonia tra sequenze di corrispondenza in un gruppo target e un assembly di riferimento per layout i contigli (o gli scaffolds) nel gruppo target. Lo strumento fornisce una visualizzazione interattiva del layout calcolato e il risultato può essere importato nell'utensile di modifica del montaggio compiuto per supportare la progettazione di coppie primer per la chiusura del gap. Nota: libero per scopi accademici. Caratteristiche principali: Legge due file FASTA (Contigs del gruppo target e sequenza di riferimento / Assemblaggio) e un file BLAST / NUCMER è in grado di ordinare e ordinare entrambi gli assi simultaneamente se le sequenze di destinazione e di riferimento sono assemblati incompiuti è applicabile ai genomi procinoratici ed eucariotici ha diverse possibilità per filtrare e adattare i dati come la ritagli di estremità contigning non corrispondenti, filtrando i colpi di esplosione, ... Esportazioni Risultati Views su diversi formati grafici (.jpg, .gif, .eps, .png e .svg.) modifica o genera un nuovo file ACE direttamente importato in assetto per il design semplificato Primer Fornisce utili funzionalità di zoom facilita l'analisi visiva di assemblelli e meta-assemblee ad es. si verifica rispettivamente di ricombinazioni o misassembliemi.
Ostay. Software correlato