OpenFLUX è una semplice applicazione di modellazione basata su MATLAB appositamente progettata per l'analisi del flusso metabolico del 13C (MFA). Le tecniche moderne come EMU sono implementate per un calcolo efficiente. Un tipico MFA con OpenFLUX è costituito da un modello di configurazione del modello (in un'applicazione di fenditure come OpenOfficee.org Calc o MS Office Excel), una generazione di modelli utilizzando la GUI Java distribuita con OpenFlux e l'analisi stessa in Matlab.
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