Nemo. Studia la cronologia dei set fenotipici
Scarica ora

Nemo. Classifica e riepilogo

Nemo. Tag

estrattore estratto Analizzare carta geografica simulazione simulare simulatore statistiche rete Statistiche di rete mutazione popolazione popolazione mostra la popolazione popolazione mondiale stima della popolazione Simulazione della genetica mendeliana. analizzare la genetica mendeliana Analisi della genetica mendeliana Genetica emulata Genetica della trasmissione Laboratorio di genetica Ricerca genetica genetica Evoluzione della genetica della popolazione distribuzione della popolazione Algoritmo genetico Simulatore di genetica della popolazione Genetica della popolazione Simulare il bottleneck della popolazione Collo di bottiglia della popolazione simulatore genetico di popolazione Simulatore di popolazione Dinamica della popolazione monitor della popolazione popolazione di autotetraploide Analisi della genetica della trasmissione simulare la genetica della trasmissione Abitizzazione della popolazione stimare i parametri della popolazione Dimensioni della popolazione efficace Struttura genetica della popolazione simulare la genetica evolutiva simulare la popolazione Simulazione della popolazione popolazione demografica popolazione genetica Definire i gruppi di popolazione gruppo di popolazione Popolazione Haploid stratificazione della popolazione analizzare la popolazione analisi della popolazione Simulazione genetica della popolazione

Nemo. Descrizione

Nemo è un software di simulazione a testa anteriore, geneticamente esplicito, basato individuale e stocastico appositamente costruito per studiare l'evoluzione della storia della vita / dei tratti fenotipici e della genetica della popolazione in un quadro flessibile (meta-) popolazione. Nemo implementa molti eventi di ciclo di vita diversi e tratti evolvenibili con una varietà di architetture genetiche. L'interazione delle specie tra un parassita e il suo host può anche essere modellato (cioè, cytoplasmic-incompatibilità che induce endosymbiont: Wolbachia). Tutto ciò è incorniciato all'interno di un modello di metapopolazione flessibile che consente capacità di trasporto specifiche di patch, tassi di dispersione, tassi di estinzione stocastica / tassi di raccolta e stoccacasticità demografica. Le popolazioni possono essere modificate dinamicamente durante una simulazione, consentendo a colli di bottiglia della popolazione, fusione patch / fisson, espansione della popolazione, ecc. La selezione spazialmente eterogenea sui tratti quantitativi può anche essere modellato. Caratteristiche principali: Tratti: Marcatori neutri (microsatelliti, SNPS) Mutazioni deleterie (con effetti fissi o casuali specifici del locus e dominanza) Tratti quantitativi (nuovi in V2.2.0) (con loci quantitativi pleiotropic) Dispersal (espressione maschile e femminile) Wolbachia (Incompatibilità citoplasmatica ereditata materna inducente endosymbiont) Eventi del ciclo di vita: Allevamento (con promiscuità, polygyny, monogamia, self-seling e sistemi di accoppiamento di clonazione) Dispersione (Piscina migrante / Propaghe Piscina Isola Modello, modelli di reticoli 1D e 2D, ecc.) Invecchiamento (con regolazione della patch del soffitto) Selezione della vitalità (basata su mutazioni deleterie o selezione della stabilizzazione sui tratti quantitativi) estinzione / raccolta Patch fusion / fissione Design per attraversare (disegni full-sib / half-sib)

Nemo. Software correlato