Multigeneblast.

Identifica l'omologo dei moduli multi-geni come gli operoni e i cluster geni.
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Multigeneblast. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • GPL
  • Prezzo:
  • Free
  • Nome editore:
  • By MultiGeneBlast
  • Sistemi operativi:
  • Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP
  • Requisiti addizionali:
  • None
  • Dimensione del file:
  • 11.7 MB
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Multigeneblast. Tag


Multigeneblast. Descrizione

Multigeneblast è uno strumento open source basato su una riformattazione delle intestazioni FASTA delle voci di proteine NCBI Genbank, utilizzando il quale può rintracciare il loro nucleotide della fonte e le coordinate. Multigeneblast può aiutare nel rilevamento di tali parti multigene per progetti di biologia sintetica. Una libreria sintetica degli operoni può essere creata in base alla sua output per identificare quegli operoni la cui funzione è più vicina a quella desiderata dall'utente. Questo strumento fornisce le opportunità di identificare tutte le regioni genomiche omologa combinando i risultati delle singole corse BLASTP su ciascun gene e ordinando le regioni genomiche da qualsiasi ingresso Genbank per il numero di colpi, la conservazione della sinteia e il punteggio cumulativo. Le ricerche di architettura possono essere eseguite per trovare qualsiasi regioni genomiche con colpi di esplosione a qualsiasi combinazione specificata dall'utente di sequenze di amminoacidi.


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