Mesa. consente di manipolare i set di dati in modi sofisticati
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Mesa. Descrizione

Phylogenies stanno fumando pistole. Una storia evolutiva trasporta nella sua stessa forma le impronte digitali di ogni processo che ha effettuato la sua creazione: estinzioni, adattamenti chiave, radiazioni, colonizzazioni, cambiamenti nel tempo e modalità di macrovoluzione. Sfortunatamente analizzare la phylogies è difficile. I calcoli di interesse per qualsiasi investigatore sono talvolta intricati e ad alta intensità di lavoro. Sono anche spesso in molti programmi, se c'è affatto un'implementazione del software. Il significato statistico dei risultati spesso richiede il confronto di centinaia a migliaia di alberi. Infine, le metriche possono essere fragili alla modalità di evoluzione una filogenia cresciuta sotto. Il risultato di questi problemi è che l'analisi filogenetica è spesso duro lavoro, ed è difficile sapere cosa fare delle risposte. L'applicazione MESA è stata progettata per alleviare questi problemi. Sebbene Mesa abbia davvero quattro cose, la grande vittoria per gli investigatori è che tutti questi sono in un unico pacchetto software e può essere utilizzato in combinazione con l'altro e semi-automatizzato. Pertanto, i problemi di trasferimento di dati tra programmi e possibile corruzione o mistipretazione dei risultati vengono evitati. Caratteristiche principali: Manipolazioni: Mesa consente di manipolare i set di dati in modi sofisticati. Gli alberi filogenetici e i tratti della storia della vita possono essere modificati, duplicati o cancellati. Le lunghezze possono essere modificate sistematicamente, taxa cancellata in base a condizioni complesse, tratti modificati a livello globale e selettivo. L'intero set di dati può anche essere sottoposto a backup e ripristinato in qualsiasi momento. analizza: Mesa incorpora un gran numero di calcoli che possono analizzare la diversità all'interno di una filogenia (ad esempio la diversità filogenetica), la diversità tra le comunità (ad es. Indice di Shannon-Weiner), misure di processo macrovolutivo (ad es. Squilibrio di fusco-cronk) e raccogliere informazioni selettivamente attraverso taxa (ad es. Simulazioni: Mesa consente di coltivare i filogeni sotto scenari sofisticati in cui i tassi di specifica e di estinzione possono essere effettuati dai tratti dei taxa coinvolti o gli attributi globali della filogenia. Le simulazioni possono essere ulteriormente adornate da estinzioni di massa e l'evoluzione dei tratti della storia della vita. Automazione: Per consentire la produzione e il test di un gran numero di filogeni, Mesa consente agli utenti di costruire catene di azioni (manipolazioni, analisi e simulazioni) che possono essere eseguite come un'unità singola, looping su gruppi di comandi, risparmio e ripristino dati. Quindi si può facilmente generare test un gran numero di replicati per la validità statistica.

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