Mcrate.

Calcola la relativa tariffa evolutiva con l'aiuto di questo strumento.
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Mcrate. Classifica e riepilogo

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  • Itay Mayrose
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Mcrate. Tag


Mcrate. Descrizione

Il grado in cui un sito amminoacidi è libero di variare è fortemente dipendente dalla sua importanza strutturale e funzionale. Un amminoacido che svolge un ruolo essenziale, come uno all'interno del sito attivo della proteina, è improbabile che cambi il tempo evolutivo. Quindi, il tasso evolutivo a un sito amminoacido è indicativo di come conservare questo sito, e a sua volta, consente di valutare l'importanza di questo sito nel mantenere la struttura o la funzione della proteina. McRate è uno strumento utile e facile da usare appositamente progettato per calcolare la relativa tariffa evolutiva in ciascun sito utilizzando un modello evolutivo basato su probabilist. Ciò consente di tenere conto del processo stocastico alla base dell'evoluzione della sequenza all'interno delle famiglie di proteine. Soprattutto, McRate utilizza la metodologia Markov Catena Monte Carlo (MCMC) per integrarsi sullo spazio di tutti gli alberi possibili. Quindi, mcrate non assumono un albero filogenetico preesistente in cui le sequenze si riferiscono. Il mcrato è stato trovato per essere superiori sopra i metodi na? VE che si basano solo su un singolo albero.


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simula l'evoluzione delle proteine con questa applicazione. ...

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