Mapmaker. Un programma per analisi genetica del collegamento
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Mapmaker. Classifica e riepilogo

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Mapmaker. Descrizione

MapMaker è un insieme di applicazioni che possono essere utilizzate per costruire mappe di collegamento genetico e eseguire la mappatura dei geni. Consegnato all'interno di un pacchetto leggero, fa impacchettare due strumenti a riga di comando, cioè MapMaker / EXP e MapMaker / QTL. Il primo è dotato di opzioni per la generazione dei gruppi di collegamento primario e analizzare l'uscita per determinare i marcatori dominanti, co-dominanti e recessivi, mentre quest'ultimo ti aiuta a mappare i geni facendo uso delle mappe di collegamento precedentemente generate. MapMaker / EXP funziona con file di testo ASCII piatto che contengono il set di dati derivati da vari tipi di croci (backcross, intercross, testicolo, dati aploidi). L'altra applicazione funziona solo con dati intercrocs e backcross F2. Si inizia preparando il set di dati per l'analisi e caricarlo in MapMaker / EXP. L'applicazione viene fornita con una vasta gamma di comandi che è possibile utilizzare per elencare, modificare, nominare o cancellare sequenze genetiche, inserire i marcatori all'interno di una sequenza. È possibile utilizzarlo per eseguire l'analisi a coppie per coppie di marcatori e condurre analisi multi-punto. Può assegnare i marcatori a un cromosoma e visualizzare lo stato della mappatura di alcuni loci. Il programma è dotato di funzionalità di rilevamento degli errori di genotipizzazione e consente di unirti a HAPLOTYPES insieme in un singolo set di dati. Può salvare i dati in un database e salvare lo stato e i risultati della mappatura sul computer. MapMaker / QTL è utilizzato per la mappatura genica, con vari comandi di tratto e che consente di salvare i dati ottenuti in PostScript, confrontare le mappe QTL e così via.

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