Hapsim.

Simula i dati di Association Case-Control con questo piccolo strumento.
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Hapsim. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • Freeware
  • Nome editore:
  • Bernard North
  • Sistemi operativi:
  • Windows All
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Hapsim. Tag


Hapsim. Descrizione

Hapsim è una piccola applicazione basata su richiesta dei comandi progettata per simulare i dati di associazione del caso-controllo in cui un locus di suscettibilità della malattia è potenzialmente in stretto collegamento con un gruppo di marcatori bialleleici che possono essere strettamente collegati l'uno con l'altro. La procedura è composta da diverse fasi e genera un file di output contenente campioni ugualmente dimensionati di individui interessati e non affetti con i loro genotipi. Il genotipo del locus di suscettibilità della malattia stesso non è output ma viene utilizzato per generare i fenotipi del caso e di controllo in base a un modello di malattia specificato dall'utente. Il processo di simulazione è composto da cinque fasi distinte: mutazione per produrre marcatori; ricombinazione tra i marcatori; mutazione per produrre uno o più alleli della malattia; ricombinazione tra malattia e luci di marcatori; Selezione del campione Conditional su un modello di malattia.


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