Hapedit. Haplotyype Assembly Viewer basato su Java
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Hapedit. Classifica e riepilogo

Hapedit. Tag

PHP. asp. html. HTML Editor. PHP Editor. montaggio editor di asp valutazione Sequenza del DNA Modifica HTML. Haplotype.

Hapedit. Descrizione

Hapedit è uno strumento che è stato costruito appositamente per aiutare l'utente a valutare l'accuratezza dell'assemblea di aplotipo. Questo viene fatto usando le tecnologie di sequenziamento della prossima generazione. Hapedit è uno strumento che è stato creato con l'aiuto del linguaggio di programmazione Java e può essere eseguito su più piattaforme. Caratteristiche principali: Invece di una sequenza di consenso aploide, i segmenti di aplotipo vengono visualizzati nella parte superiore della finestra di assemblaggio di Haplotipo. Un punteggio di qualità che valuta la precisione per i segmenti di aplotipo assemblati è mostrato sotto i segmenti di aplotipo Un nome di lettura è colorato, riflettendo la tecnologia di sequenziamento utilizzata per la lettura. Le chiamate di base sono colorate in modo differenziale in base ai loro punteggi di qualità. Questo facilita un utente per trovare chiamate di base di bassa qualità. Facendo doppio clic su una regione specifica nella finestra di navigazione del montaggio, un utente può vedere la visualizzazione dettagliata della regione visualizzata nella finestra di assemblaggio di Haplotipo. I segmenti di aplotipo maldeminti possono essere suddivisi in pezzi. La connessione dei segmenti di aplotipo confermata da dati supplementari è abilitata da semplici operazioni del mouse. I tassi di composizione delle tecnologie di sequenziamento sono analizzati e visualizzati nei grafici a barre. Allo stesso modo, la copertura della sequenza e del clone sono anche riassunti nei grafici a torta.

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