Genemir. Ricerca unificata delle previsioni del bersaglio dei microrna dei mammiferi.
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Genemir. Classifica e riepilogo

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Genemir. Descrizione

L'applicazione software Genemir è uno strumento rivolto ai biologi e ai bioinformatici che desiderano trovare modelli di previsione e espressione in serie di microRENS e geni. Il programma funziona con il mouse e la previsione dell'obiettivo umano e i dati di espressione. È possibile effettuare uno dei due tipi di query selezionando: · Uno o più microrno; · Uno o più geni o trascrizioni; per ottenere rispettivamente: · Un elenco di geni previsti per essere mirati dai microRNAS selezionati; · Un elenco di microRNAS previsto per indirizzare i geni selezionati e un elenco completo dei geni rivolti a quei microRornas. Ciascuna di queste query può essere modificata dai filtri, che consentono all'utente di selezionare / deselezionare uno qualsiasi degli algoritmi di previsione e specificare i criteri di soglia che determinano il set di microRENS o geni restituiti. I livelli di espressione di ciascun elemento nel set di output nonché l'espressione media di tutti i geni in quel set possono essere visualizzati come istogramma. Istogrammi Visualizza i livelli di espressione attraverso diversi tessuti misurati nel set di dati Symatlas GNF (vedere la sezione dei tipi di dati), in media dei valori di espressione di ciascun probeset che rappresentano lo stesso gene. I dati di espressione esterni possono anche essere importati e visualizzati allo stesso modo (consultare la sezione di tendenza dell'espressione e la sezione dei dati di espressione di carico). Ogni elemento nel set di risultati può essere collegato a risorse Web esterne. Qualsiasi elenco di geni in conformità con il formato descritto nella sezione Formato file di conversione può essere elaborato dalla funzione Converti IDS in uno dei quattro diversi identificatori geni: refseq, simbolo del gene, GNF / Affymetrix e Ensembl. Dai a GeneMir, prova a vedere cosa è davvero capace!

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