GPS

Studio Interazione proteica-DNA con dati chip-seq.
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GPS Classifica e riepilogo

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  • GPS Team
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GPS Descrizione

Il sistema di posizionamento del genoma (GPS) è uno strumento software per studiare l'interazione proteica-DNA utilizzando i dati di chip-seq. GPS costruisce un modello di miscela probabilistico per prevedere le posizioni più probabili degli eventi vincolanti nella risoluzione monostrata. GPS è un software Java, quindi funziona su più piattaforme, incluso Mac OS X, Windows, Unix e Linux. GPS è multi-filettato, consentendo agli utenti di sfruttare la CPU multi-core. È stato pubblicato su Bioinformatics. 201021 ottobre 2010 . PMID: 20966006. Ottieni GPS e prendilo per una rotazione per vedere cosa può effettivamente fare per te! Caratteristiche principali: Raggiungi un'elevata risoluzione spaziale sui previsti eventi vincolanti Risolvi eventi strettamente distanziati (meno di 500bp) che appaiono come un singolo cluster di letture Procedere il set di dati più contemporaneamente per allineare gli eventi comuni attraverso esperimenti distinti


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