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sequenza sequenza proteica genoma

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I cluster ortologici virali (VOC) è una GUI Java facile da usare utilizzata per accedere ai database del genoma VBRC. I cluster ortologici virali hanno un'interfaccia semplice e completa che ti guiderà rapidamente attraverso tutte le sue caratteristiche. Caratteristiche principali: Ricerca ed estrai dati genoma, gene e proteine dal database. Selezionare i dati (ad esempio una serie di geni) e quindi analizzalo con gli altri strumenti VBRC, ad esempio Genera più allineamenti multipli con base-by-base Crea Dotplots con JDotter Sfoglia i genomi completi con l'organizzatore del genoma virale (VGO) Esegui esplorazione di BLAST Ricerche sui database NCBI e VBRC Plot DNA Skews con Dnagrapher Crea mappe del genoma Confronta i genomi e le serie di genomi, ad esempio. Trova famiglie geniche rappresentate in tutti i genomi di Poxvirus (Geni Core Poxvirus) Trova famiglie geniche presenti nei virus Variola, ma non nei virus di vaccino o vaccinia (potenziali geni di virulenza) La VBRC utilizza una versione amministratore di VOC per aggiungere genomi, annotate geni e classificare le famiglie geniche

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