Clusal X.

Questa applicazione è dotata di un programma di allineamento in sequenza multiple generico per il DNA o le proteine.
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Clusal X. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • Freeware
  • Nome editore:
  • The European Bioinformatics Institute
  • Sistemi operativi:
  • Windows All
  • Dimensione del file:
  • 4.7 MB

Clusal X. Tag


Clusal X. Descrizione

Clustal X è un programma avanzato che si occupa di più allineamento di sequenze per proteine e DNA. Progettato come GUI per Clustalw, il programma esegue l'analisi della sequenza approfondita, offrendo anche molte utilità per eseguire comparazioni adeguate. Carica i più formati specializzati Il programma è in grado di lavorare con sequenze pronta, importati da file dei seguenti formati: EMBL / Swissprot, Nbrf / Pir, Pearson (Fasla), GCG / MSF (piletup), clusal (* .aln), GCG9 / RSF e GDE. Durante il processo di importazione, Clusal X tenta di rilevare se le sequenze sono nucleotidi o amminoacidi, ma non c'è garanzia effettiva che la scelta sarà corretta. Evidenziazione intelligente Elementi importanti Il file sorgente è stato caricato, l'allineamento della sequenza verrà visualizzato nella finestra principale del programma. Lo schema da colorare incorporato serve ad evidenziare le caratteristiche conservate, rendendoli spunti tramite colori vividi. Per distinguere il contenuto delle sequenze, si consiglia di utilizzare un font più grande; Ciò comporterà una visione della sequenza ingrandita, rendendo più facile individuare la sua composizione. Easy Alignment Process Le operazioni consentite dal programma rendono il proprio elenco; È possibile aggiungere una sequenza a un allineamento esistente, tagliare o incollare un frammento, oltre a cercare una stringa o rimuovere le lacune esistenti. Inoltre, è possibile eseguire gli allineamenti tramite uno dei seguenti metodi: completare (la sequenza sarà sottoposta ad un'analisi completa), solo l'albero guida o un riallineamento delle sequenze selezionate e / o dei residui di residui. Si consiglia di iniziare un processo di allineamento, ripristinare tutti i parametri (nuovi lacune, lacune proteiche) affinché i risultati siano conclusivi. Analizzare i dati e ottenere un punteggio di qualità di allineamento del più importante indicativo dell'analisi sarà il punteggio di qualità dell'allineamento, che viene tracciato per ogni colonna individualmente. Un punteggio elevato designa una colonna ben conservata, mentre i bassi livelli di conservazione sono indicati da un punteggio inferiore. In conclusione, l'analisi dipende da una varietà di parametri, che dovrebbe essere fissata in conformità con lo scopo scientifico che deve essere effettuato. Sicuramente, il programma fa un'ottima scelta per gli scienziati, così come gli studenti che stanno cercando di fare un portatore fuori dal sequenziamento del DNA. Recensito da Andreea Matei, ultimo aggiornamento il 21 luglio 2014


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