Chimerabuster. Uno strumento utile per l'analisi della sequenza di Chimera
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Chimerabuster. Classifica e riepilogo

Chimerabuster. Tag

sequenza Fasta Analizzatore di sequenza

Chimerabuster. Descrizione

Chimerabuster è un'applicazione specificamente sviluppata per la ricerca di sequenze di chimeriche putative nelle librerie di cloni con un'alta copertura. Le chimere sono formate durante l'amplificazione PCR e le sequenze comprendono due frammenti (o più) derivati da altre due sequenze (sequenze genitore). Pertanto, per la forma di Chimeras, entrambe le sequenze dei genitori devono esistere durante il processo di amplificazione. Le programmi Chimera esistenti interrogano i database di sequenza esterni per cercare sequenze genitori. Tuttavia, per un gran numero di sequenze è difficile concludere con alta probabilità che avessero avuto origine da distinte sequenze genitoriali perché non sono presenti parenti sufficientemente stretti nei database come Genbank o RDP. Dal momento che Chimerabuster è completamente scritto nel linguaggio di programmazione Java, non ci dovrebbero essere problemi a eseguirlo su una varietà di piattaforme.

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