Cbcanalyzer. Philogeni inferiori in base alle variazioni di base compensative (CBCS)
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Cbcanalyzer. Classifica e riepilogo

Cbcanalyzer. Tag

simulare fylogenies. simulazione di filogeni stimare grandi filyogenies. Grandi stima di Phylogenies. Grandi analisi di filyogenies. Cambio base compensativo TRASFORMATORE CT Rilevamento della CBC. Cttransform. Cbcdetect. CBCTree

Cbcanalyzer. Descrizione

Il CBCanalyzer (CBC = Change Base compensativo) è stato sviluppato per essere una casella degli strumenti software scritti personalizzati composta da tre parti, cttransform, cbcdetetect e cbctree. CTTRAnsForm legge diversi formati di file CT (CT, RNAVIZ CT o Mac CT) e genera un formato così chiamato "Bracket-Dot-Bracket" che tipicamente viene utilizzato come input per altri strumenti come Rnaforster, Rnamovie o Marna. Quest'ultimo crea un allineamento multiplo basato su sequenze primarie e strutture secondarie che ora possono essere utilizzate come input per CBCDetect. Conto che contiamo per le CBC in tutto contro tutte le sequenze allineate, che è importante per rilevare le specie, discriminato sulla loro incompatibilità sessuale. La matrice di conteggio (distanza) ottenuta da cbcdetect viene utilizzata come input per cbctree che ricostruisce un filogramma utilizzando l'algoritmo di Bionj.note: CBCanalyzer è disponibile liberamente per uso non commerciale

Cbcanalyzer. Software correlato