Caryoscope. Visualizzazione dei dati di espressione in un contesto del genoma intero.
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Caryoscope. Classifica e riepilogo

Caryoscope. Tag

spettatore Visualizza dati genici Dati di espressione

Caryoscope. Descrizione

Il caryoscope è un componente UI Java riutilizzabile e un insieme di utilità di analisi, utensili da riga di comando e una GUI dell'applicazione per la visualizzazione dei dati di espressione genica in un contesto del genoma. Il caryoscope è un pacchetto software che consente di visualizzare ed esplorare i dati numerici in funzione della posizione genomica. Ad esempio, il caryoscope è stato utilizzato per "disegnare" i dati di microarray su un insieme di cromosomi in modo che le modifiche al numero di copia del DNA possano identificare le regioni della perdita o della duplicazione del cromosoma all'interno del genoma delle cellule tumorali (Genet NAT. 1999 sep; 23 (1) : 41-6). Inoltre, i dati del microarray che misurano i livelli di espressione dell'mRNA possono anche essere visualizzati in un contesto genomico utilizzando il caryoscope (PNA 200210 dic 10; 99 (25): 16144-9). I dati visualizzati con il caryscope non devono essere limitati ai dati di microarray - qualsiasi tipo di dati numerici che possono essere rappresentati come funzione della posizione genomica possono essere visualizzati utilizzando il caryoscope. Prendi il caryoscope e prova a provare a vedere cosa si tratta!

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