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Browser del genoma saggio. Classifica e riepilogo
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- Computational Biology Lab
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- 33.4 MB
Browser del genoma saggio. Tag
Browser del genoma saggio. Descrizione
Savant Genome Browser è un uso pratico, facile da usare, applicazione di visualizzazione Java appositamente progettata per i dati genomici. È stato sviluppato principalmente per visualizzare i dati di sequenziamento ad alto throughput (AKA Next Generation), sebbene possa essere utilizzato per visualizzare praticamente qualsiasi sequenza basata su genoma, punto, intervallo o set di dati continui. Caratteristiche principali: FASTS, BED, SAM / BAM, parrucca, GFF e praticamente qualsiasi file di testo delimitato da schede contenente annotazioni posizionali Accesso dei dati veloce scalabile a file di input molto grandi Piccolo impronta di memoria Zooming, Panning e Cerco utilizzando comandi di intervallo o tastiera e mouse Moduli ancorabili Supportano Mostra / Nascondi, Riorganizzazione, Massimizza, Galleggiante, Chiudi Vista compatta della sequenza, del punto, dell'intervallo e delle tracce continue Modalità di visualizzazione multiple per tipi di traccia specifici Funziona su Windows, Linux, Mac e qualsiasi altra piattaforma con supporto per la macchina virtuale Java Framework plugin consente l'accesso a dati, tracce e interfaccia utente per una personalizzazione approfondita Bookmarking of Locations Track Blocking Rappresentazione nuova di letture accoppiate che rendono le variazioni strutturali facili da identificare
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