Blastalign.

allineerà le sequenze di nucleotidica
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Blastalign. Classifica e riepilogo

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  • Rating:
  • Licenza:
  • Freeware
  • Nome editore:
  • Aris Katzourakis
  • Sistemi operativi:
  • Windows All
  • Dimensione del file:
  • 180 KB

Blastalign. Tag


Blastalign. Descrizione

L'applicazione Blastalign utilizza NCBI BLAST per allineare le sequenze di nucleotidica che hanno Industria di grandi dimensioni (inserzioni / cancellazioni) o sono altrimenti difficili da allineare a livello globale. Il programma seleziona la sequenza più rappresentazione dalle sequenze di input e quindi estrae la query di esplorazione di allineamento multiplo ancorato (in formato Nexus e Phylip). In alternativa, l'utente può scegliere quale sequenza utilizzare come ancoraggio. Il programma produce anche una matrice che rappresenta regioni di omologia lungo le sequenze, che possono essere utilizzate per identificare visivamente i sottogruppi che condividono particolari didi di grandi dimensioni. Un programma aggiuntivo, BlastaLignp utilizza TBLASTN per allineare sequenze di nucleotidica su una singola sequenza di riferimento amminoacidi, consentendo un telaio di lettura aperto da mantenere nell'allineamento multiplo.


Blastalign. Software correlato