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Associazione Viewer. Descrizione

AssociationViewer è un programma basato su Java progettato per essere utilizzato nell'analisi dell'intera genoma per visualizzare SNP in un contesto genomico. I dati supplementari vengono scaricati da varie origini dati pubbliche sul volo e salvati localmente in una cache e dati personalizzati possono essere aggiunti come tracce supplementari. Caratteristiche principali: Visualizza SNPS e i loro valori P in un contesto genetico, simili ai soliti browser genoma Scarica automaticamente le informazioni supplementari da Ensembl / Biomart Display HapMap LD Plot Stampa ed esporta il display in vari formati di dati Importa file di dati esterni come Bed o Wiggle come tracce supplementari non richiede di avere una copia locale di alcun dato o origine dati, ad eccezione del file primario di SNP e dei rispettivi valori P Gli utenti possono scorrere e sfogliare i propri dati in tempo reale di dimensioni ridotte (AssociationViewer stesso è inferiore a 800 Kb, meno di 5 MB con le librerie richieste) I dati scaricati vengono conservati in una cache localmente per un accesso più rapido A causa della cache, il requisito della memoria è ragionevole

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