Asimmetrycounter. Numero di conteggio delle sostituzioni in ciascuna direzione per coppie di amminoacidi.
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Asimmetrycounter. Classifica e riepilogo

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Analizzare Contatore Contare acidi Direzione arbitraria Trova aminoacido Finder Aminoacid cercare amminoacido Analizzatore di aminoacidi Sequenza di amminoacidi amminoacido Traduttore di amminoacidi estrarre aminoacidi residui di amminoacidi aminoacido ottimale Analizzare l'aminoacido numero di sostituzioni del conteggio analizzare la coppia di aminoacidi Analisi delle coppie degli aminoacidi Analizzare la sequenza di amminoacidi Classificazione di amminoacidi Topologia aminoacidica. Rilevatore di amminoacidi rilevare aminoacidi analizzare gli acidi poliprotici Analizzare la catena di amminoacidi coppie di crenatura

Asimmetrycounter. Descrizione

AsymmetryCounter è un piccolo prompt dei comandi basato appositamente progettato per prendere il file delle sequenze allineate prodotte da ambiguityremover e conta, per ogni coppia di aminoacidi, il numero di sostituzioni in ciascuna direzione. Compara il rapporto tra sostituzioni in una direzione e sostituzioni nella direzione opposta al rapporto atteso 1: 1 utilizzando un test di bontà di adattamento. Se una coppia di amminoacidi ha meno di 50 sostituzioni totali, viene utilizzato il test binomiale esatto e il valore p è riportato; Se ci sono 50 o più sostituzioni, viene utilizzato il test G della bontà dell'adattabilità e il valore G e il valore P. Se il valore G è maggiore di 454, il valore P è dato come "

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