Analisi di segnalazione e visualizzazione Un software per calcolare il clustering, il diametro, la distribuzione della connettività e il rilevamento e la visualizzazione dei motivi di rete
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Analisi di segnalazione e visualizzazione Descrizione

Il processo di scoperta dei percorsi di trasduzione del segnale cellulare ha raggiunto una fase in cui i percorsi sono combinati per formare grandi reti di interazioni. Visualizzazione delle interazioni proteiche-proteine e ligando-proteina come grafici (reti) in cui sono rappresentati da bio-molecole in cui i vertici (nodi) e le interazioni sono rappresentati come bordi (collegamenti) è un metodo utile per consolidare e organizzare prove sperimentali da più fonti per raggiungere più fonti -Level comprensione di come i percorsi controllano i fenotipi cellulari. L'emergere di set di dati di reti su larga scala fatta di componenti e interazioni cellulari offre l'opportunità di analisi topologiche statistiche e la sfida della visualizzazione della rete. Si applica anche i metodi di teoria dei grafici applicati a sistemi complessi in altri campi per analizzare le reti cellulari bio-molecolari. Savi è un programma desktop che implementa metodi standard per calcolare il clustering, il diametro, la distribuzione della connettività e la rilevazione e la visualizzazione dei motivi di rete. Inoltre, Savi genera un sito Web completo dai set di dati di rete in formato testo. Savi contiene uno strumento chiamato PathwayGenerator. Questo strumento crea le mappe di connessione di segnalazione come pagine Web da grandi dataset di interazioni. Savi può anche generare una rete di interazioni quando viene fornita un elenco dei nomi dei geni umani.

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