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Calcolare Stima estimatore Computa Covariance. Computa i miei stimatori il calcolo dei miei stimatori stima del coefficiente di additivi stimatori

Ammixe. Descrizione

Admix è un'applicazione piccola, semplice e facile da usare progettata per aiutarti a calcolare gli stimatori a pochi passi. I file di input possono essere: · 1a riga: Ora negli anni nell'evento di Adjxture (se questa volta non è noto, è necessario scrivere 0!) · 2a riga: tasso di mutazione per anno (in caso di tempo per l'evento di additivi nella linea precedente, si dovrebbe indicare una velocità di mutazione!) · 3a linea: numero di popolazioni genitoriali · 4a riga: numero di loci · Le seguenti linee: per ogni loci: · 1a linea: nome del locus (questa linea deve contenere almeno un carattere!) · 2a riga: numero di aleli diversi (k) osservati a quel locus · Prossime linee K: matrice triangolare inferiore che specifica le distanze molecolari tra gli alleli. Nel caso di sequenze di DNA o RFLPS, la distanza molecolare tra 2 alleli è solo il numero di sostituzioni. In caso di dati microsatelliti, la distanza molecolare è la differenza quadrata nella dimensione dell'allele (vedi Bertorelle ed Extorcier per maggiori dettagli). · Le seguenti linee: per ogni loci: · 1a linea: nome del locus (questa linea deve contenere almeno un carattere!) · 2a riga: Dimensioni del campione (numero di cromosomi) nelle popolazioni ammissibili e genitori di quel locus. Il primo numero si riferisce alla popolazione conmissiva. I seguenti numeri si riferiscono alle popolazioni genitoriali. · Le seguenti linee: per ogni locus, per ogni popolazione, il numero di copie osservate da ciascun allele. Ancora una volta, il primo numero si riferisce alla popolazione conmissiva, e i seguenti numeri si riferiscono alle popolazioni genitoriali.

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