Allineamento statistico veloce per Linux FSA è un algoritmo di allineamento di sequenze multiple probabilistiche.
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Allineamento statistico veloce per Linux Classifica e riepilogo

Allineamento statistico veloce per Linux Tag

Allineamento statistico veloce per Linux Descrizione

Annuncio pubblicitario L'allineamento statistico veloce per Linux è un software di casa e formazione sviluppato da Robert Bradley. Dopo il nostro processo e test, il software è dimostrato di essere ufficiale, sicuro e gratuito. Ecco la descrizione ufficiale per un rapido allineamento statistico per Linux: FSA è un algoritmo di allineamento di sequenze probabilistici in sequenza che utilizza un approccio "basato su distanza" per allineare sequenze di proteine omologhe, RNA o DNA. Molto come metodi di ricostruzione filogenetica basata sulla distanza come il need-joint build a Phylogeny utilizzando solo stime di divergenza coppia, FSA costruisce un allineamento multiplo utilizzando solo stime a coppie di omologia. Ciò è reso possibile dalla tecnica di ricottura della sequenza per la costruzione di un allineamento multiplo dai confronti a coppie. L'FSA porta le massime accurate precedentemente disponibili solo per analisi su piccola scala di proteine o RNA a problemi su vasta scala come allineare migliaia di sequenze o sequenze megabase. FSA introduce diversi metodi nuovi per la costruzione di allineamenti migliori: FSA utilizza tecniche di apprendimento della macchina per stimare i parametri di gap e sostituzione al volo per ogni set di sequenze di input. Questo metodo di allineamento "didattico specifico della query" rende la FSA molto robusta: può produrre allineamenti superiori di serie di sequenze omologhe soggette a limiti evolutivi molto diversi. L'FSA è in grado di allineare centinaia o anche migliaia di sequenze utilizzando un algoritmo di inferenza randomizzato per ridurre il costo computazionale di più allineamento. Questa inferenza randomizzata può essere oltre dieci volte più veloce di un approccio diretto con poca perdita di precisione. FSA può allineare rapidamente sequenze molto lunghe utilizzando la tecnica "Anchor Renaning" per risolvere gli ancore e proiettarli con ancoraggio transitivo. Quindi si riunisce insieme l'allineamento tra gli ancore usando i metodi sopra descritti. La GUI INCLUSS INCLUSO, MAD (multiple di visualizzazione di allineamento), può visualizzare gli allineamenti intermedi prodotti da FSA, dove ogni carattere è colorato secondo la probabilità che sia correttamente allineata

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